fix(t86b): manifest 分實例——換知識庫後同資料夾不再被舊帳跳過

根因：manifestPathFor 雜湊只含資料夾路徑，換實例讀到舊帳本
→ 全部檔案被視為已同步 → 新知識庫靜默拿不到資料（leo 機實證：刪 manifest 才通）。
- instanceHostOf：CypherURL 的 host 作為實例鍵
- manifestPathFor：sha256(host+"\n"+absRoot)，單根多根統一公式
- migrateManifestIfNeeded：新名不在、舊名在 → rename 過戶（一次性、冪等）
- 換回舊實例帳本仍在＝不重傳（每實例一本帳，設計目標）
已知殘窗（記 tasks.md）：升級後第一次掃描前就換實例，舊帳會被過戶給新實例
（舊格式無實例資訊，無從分辨）；常態下升級後首掃已把帳過戶給舊實例，窗口極窄。
測試：新增 6 條（分實例/穩定/單根遷移/多根遷移/冪等）＋三模組全綠（總管親跑）。
（實作＝子 CC；驗證+commit＝總管）

direct.go

@@ -27,6 +27,7 @@ import (
 	"fmt"
 	"io"
 	"net/http"
+	"net/url"
 	"os"
 	"path/filepath"
 	"strings"
@@ -205,18 +206,57 @@ func (c *DirectConfig) Folders() []string {
 	return out
 }
 
-// manifestPathFor 回傳某根的 manifest 路徑。單根＝沿用 cfg.Manifest（升級不丟既有狀態）；
-// 多根＝每根一份，基底名加 root 絕對路徑的 sha256 前 8 碼尾碼（路徑穩定＝尾碼穩定）。
-func (c *DirectConfig) manifestPathFor(absRoot string) string {
-	folders := c.Folders()
-	if len(folders) <= 1 {
-		return c.Manifest
+// instanceHostOf extracts the host from a CypherURL to use as a per-instance
+// distinguisher in manifest paths (t86b). Falls back to the full URL if parsing fails.
+func instanceHostOf(cypherURL string) string {
+	u, err := url.Parse(cypherURL)
+	if err != nil || u.Host == "" {
+		return cypherURL
 	}
-	sum := sha256.Sum256([]byte(absRoot))
+	return u.Host
+}
+
+// manifestPathFor 回傳某根的 manifest 路徑。
+// t86b：雜湊改為 sha256(instanceHost + "\n" + absRoot)，讓每個（實例, 資料夾）組合對應
+// 獨立帳本——換知識庫實例後同資料夾不再重用舊帳本，避免「全部視為已同步」靜默跳過。
+// 舊格式遷移見 migrateManifestIfNeeded：啟動/掃描時若新名不存在但舊名存在則 rename 過來。
+func (c *DirectConfig) manifestPathFor(absRoot string) string {
+	host := instanceHostOf(c.CypherURL)
+	sum := sha256.Sum256([]byte(host + "\n" + absRoot))
 	ext := filepath.Ext(c.Manifest)
 	return strings.TrimSuffix(c.Manifest, ext) + "-" + hex.EncodeToString(sum[:4]) + ext
 }
 
+// oldManifestPaths 回傳 t86b 之前版本對同一個 absRoot 會產生的 manifest 路徑，
+// 供遷移時確認是否有舊帳本需要搬移。
+// 優先序：①舊多根（只含路徑雜湊）→ ②舊單根（直用 cfg.Manifest）。
+func (c *DirectConfig) oldManifestPaths(absRoot string) []string {
+	ext := filepath.Ext(c.Manifest)
+	base := strings.TrimSuffix(c.Manifest, ext)
+	// 舊多根公式：sha256(absRoot only)
+	sumPathOnly := sha256.Sum256([]byte(absRoot))
+	pathOnlyPath := base + "-" + hex.EncodeToString(sumPathOnly[:4]) + ext
+	// 舊單根公式：直用 cfg.Manifest
+	return []string{pathOnlyPath, c.Manifest}
+}
+
+// migrateManifestIfNeeded 在 newPath 不存在時，把最先找到的舊格式 manifest rename 過來。
+// 一次性、冪等：newPath 已存在時直接 return；rename 失敗靜默忽略（最多這一輪重傳，不影響正確性）。
+func (c *DirectConfig) migrateManifestIfNeeded(absRoot, newPath string) {
+	if _, err := os.Stat(newPath); err == nil {
+		return // 新路徑已存在，無需遷移
+	}
+	for _, oldPath := range c.oldManifestPaths(absRoot) {
+		if oldPath == newPath {
+			continue
+		}
+		if _, err := os.Stat(oldPath); err == nil {
+			_ = os.Rename(oldPath, newPath)
+			return
+		}
+	}
+}
+
 // directHTTP 是 direct 模式共用的 HTTP client（萃取 workflow 可能同步跑 LLM，放寬 timeout）。
 var directHTTP = &http.Client{Timeout: 300 * time.Second}
 
@@ -394,6 +434,7 @@ func runDirectOnceRoot(cfg *DirectConfig, root string, dryRun bool) ([]DirectRes
 	if err != nil {
 		return append(results, DirectResult{Status: "failed", Error: err.Error()}), 1, nil
 	}
+	cfg.migrateManifestIfNeeded(absRoot, absManifest) // t86b：一次性遷移舊格式帳本
 	m, err := LoadManifest(absManifest, absRoot)
 	if err != nil {
 		return append(results, DirectResult{Status: "failed", Error: err.Error()}), 1, nil