feat: 安裝結構收進 system-dev/(不污染用戶根目錄)+ 舊版自動遷移 + bump 1.9.0

工具產物原散在用戶根目錄(docs 七層、scripts),又把 wiki/VERSION 寄生在 CC 原生
.claude/ 裡,用戶分不清哪個 docs 是工具的。這版徹底收斂:除 .claude/(settings/
commands/hooks)與 CLAUDE.md 留根,工具所有資料收進 system-dev/。

對應 SDD: system-dev/docs/3-specs/install-layout/(內部記錄,依原則不推)。

- 新結構 system-dev/{VERSION,wiki/,docs/,scripts/};.claude/ 只剩 CC 機制檔
- wiki 改寫產物落點正式化:install 建 system-dev/wiki/cards/(.gitkeep)
- docs 雙語義拆開:工具文件→system-dev/docs/;用戶 raw source 維持原處只讀
- scripts 一開始就裝進 system-dev/scripts/
- 舊版自動遷移雙保險:update.sh 冪等搬移(wiki 含 .git、docs 白名單)
  + session-start hook 偵測舊結構未遷移時提示(low-code 用戶兜底)
- wiki-secret-scan 觸發路徑改 system-dev/wiki/**(否則新結構防護失效)
- 全套路徑引用同步:CLAUDE/SKILL/wiki-*/sdd-*/hooks/INDEX/README(中英)
- 沙盒驗證:遷移含 .git commit 一致、冪等、用戶自填 docs 保留;全 bash -n 過

Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>

template/.claude/commands/wiki-init.md

@@ -19,7 +19,7 @@
 
 唯一例外：原文是**不可改動的正式文件**（簽署過的規格、法規、合約），必須逐字讀原文——這種才在 wiki 裡用指針指回去，並註明「逐字依原文」。除此之外，一律改寫。
 
-**raw source 永遠唯讀**：所有產出只往 `.claude/wiki/` 寫，絕不改動、搬移、重新命名原文。
+**raw source 永遠唯讀**：所有產出只往 `system-dev/wiki/` 寫，絕不改動、搬移、重新命名原文。
 
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@@ -28,7 +28,7 @@
 ### 第一步：偵測專案狀態
 
 檢查以下項目，判斷是新專案還是已有專案：
-- 根目錄有沒有 `.claude/wiki/`
+- 根目錄有沒有 `system-dev/wiki/`
 - 根目錄有沒有 `docs/`（或 vault 的 `pages/`、`journals/`、根目錄 `.md`）
 - 有沒有散落的 `.md` 檔案
 
@@ -43,7 +43,7 @@
 ### 第二步：已有專案的掃描（已有專案才執行）
 
 1. 遞迴找出 raw source 裡所有 `.md` 檔案
-2. **先套用 `.claude/wiki/.wikiignore`**：命中 pattern 的檔案整個排除，不讀不編入。
+2. **先套用 `system-dev/wiki/.wikiignore`**：命中 pattern 的檔案整個排除，不讀不編入。
    - 若 `.wikiignore` 不存在，從範本建立一份（預設排除 `.env`/`*.pem`/`*secret*` 等）
    - 被排除的檔案在清單裡標「🚫 .wikiignore 排除」，**不可被覆蓋**
 3. 對其餘檔案標注**改寫計畫**：會萃取成哪些 wiki 條目。一份原文可能拆成多個概念原子條目，多份相關原文也可能合併成一條。
@@ -66,7 +66,7 @@
 wiki 採**三層 + 標籤橫切**架構（183 卡實證，issue #8）：
 
 ```
-.claude/wiki/
+system-dev/wiki/
 ├── INDEX.md              ← 頂層：標籤視圖（不是資料夾列表）
 ├── TAXONOMY.md           ← 標籤字典（分類骨架，受控擴充：先查重再登記）
 ├── status.md / mistakes.md / decisions-summary.md
@@ -80,16 +80,16 @@ wiki 採**三層 + 標籤橫切**架構（183 卡實證，issue #8）：
 
 > **桶子索引固定叫 `00-INDEX.md`**（issue #6）：`00-` 前綴讓它排序最前、一眼可辨（像 README 之於資料夾），AI 載入任何 `cards/<bucket>/` 一律先讀它，不必猜。檔內 H1 仍寫主題名（如 `# PKM 知識管理`），語意不丟。
 
-一般專案仍可同時建 `docs/` 分類樹（SDD 等）：
+一般專案仍可同時建 `system-dev/docs/` 分類樹（SDD 等）：
 ```
-docs/{1-vision,2-architecture/decisions,3-specs,4-guides,5-records/{incidents,test-reports},6-user}
+system-dev/docs/{1-vision,2-architecture/decisions,3-specs,4-guides,5-records/{incidents,test-reports},6-user}
 ```
-（純 PKM vault 不需要 `docs/` 分類樹時，只建 `.claude/wiki/`。）
+（純 PKM vault 不需要 `system-dev/docs/` 分類樹時，只建 `system-dev/wiki/`。）
 
 檔案（不存在才建）：
-- `.claude/wiki/INDEX.md`、`TAXONOMY.md`
-- `.claude/wiki/status.md`、`mistakes.md`、`decisions-summary.md`
-- `docs/README.md`（一般專案才需要）
+- `system-dev/wiki/INDEX.md`、`TAXONOMY.md`
+- `system-dev/wiki/status.md`、`mistakes.md`、`decisions-summary.md`
+- `system-dev/docs/README.md`（一般專案才需要）
 
 ### 第四步：訪談（每次一個問題）
 
@@ -168,7 +168,7 @@ gloss: 一句話定義這個概念是什麼（給下游語義 normalize 用，
 **INDEX.md 是標籤視圖**（非資料夾列表），`00-INDEX.md` 是桶內容器（只連不重寫，H2/H3 分節）。
 頂層索引指桶子索引帶路徑：`[[pkm/00-INDEX]]`。
 
-> 與 claude.ai Cowork 的 `docs/SKILL.md` 改寫邏輯一致，兩條路徑（CC / Cowork）產出同一種 wiki。
+> 與 claude.ai Cowork 的 `system-dev/docs/SKILL.md` 改寫邏輯一致，兩條路徑（CC / Cowork）產出同一種 wiki。
 
 ### 第六步：完成報告 + 驗證