feat(graph): node gloss→base embeddable entry 橋——Arcrun#7 A1

修「打標≠讀標」：node gloss+embed 標在 entity record、但 base embed 只掃 entries.metadata.embed
→ persistNodes 另落一筆 content=canonical:gloss、metadata.embed=true 的 base entry(走 API/零SQL)。
- gloss-entry.ts: upsertGlossEntry 冪等(確定性 page_name + list-then-write)
- backfill-gloss-entries.ts + route: 對既有 entity record 補 gloss entry
- triplet-ingest 帶 source.uri 進 metadata；kbdb-client 暴露 metadata_json(base 早支援)
- vitest 30/30(+7)；[→arcrun] base 缺 upsert entry 端點,暫以 list-then-write 冪等

src/actions/backfill-gloss-entries.ts

@@ -0,0 +1,41 @@
+// 存量回填：對「已存在的 entity records」補上對應的 embeddable base entry。
+// 讀 base 既有 entity records（GET /records/by-template/entity）→ 為每筆有 gloss 的落一筆 embeddable entry
+// （同 persistNodes 前向路徑的格式與冪等）。讓既有知識立刻可被 base embed backfill 嵌到。
+// 鐵律：走 base API（API-as-Wall）、零 SQL、樂高法（<100 行、一檔一事、第一參數收 KbdbClient）。
+
+import type { KbdbClient } from '../lib/kbdb-client';
+import { TPL_ENTITY, ensurePluginTemplates } from '../lib/templates';
+import { upsertGlossEntry, type GlossEntryOutcome } from './gloss-entry';
+
+export type BackfillGlossResult = {
+  scanned: number;    // 掃到的 entity record 數
+  created: number;    // 新落的 embeddable entry 數
+  updated: number;    // gloss 變 → 更新內容的數
+  unchanged: number;  // 已存在且內容相同（冪等 no-op）
+  skipped: number;    // embed=false / 空 gloss / 空 canonical → 不落
+};
+
+/**
+ * 對既有 entity records 補 embeddable entry。冪等：重跑不造重複（同 node → 同 page_name → no-op）。
+ * embed 標為 'false' 的 record 略過（明確不入向量庫）。source 未知（存量）→ 留空。
+ */
+export async function backfillGlossEntries(
+  client: KbdbClient,
+  owner_id?: string,
+): Promise<BackfillGlossResult> {
+  await ensurePluginTemplates(client);
+  const records = await client.listRecordsByTemplate(TPL_ENTITY, owner_id);
+  const res: BackfillGlossResult = { scanned: records.length, created: 0, updated: 0, unchanged: 0, skipped: 0 };
+
+  for (const r of records) {
+    const v = r.values;
+    if (v.embed === 'false') { res.skipped++; continue; } // 明確標不嵌 → 略過
+    const outcome: GlossEntryOutcome = await upsertGlossEntry(
+      client,
+      { canonical: v.canonical ?? '', node_id: v.node_id || '', gloss: v.gloss ?? '', source: '' },
+      owner_id,
+    );
+    res[outcome]++; // 'created' | 'updated' | 'unchanged' | 'skipped' 都是 res 的 number 欄位
+  }
+  return res;
+}

src/actions/gloss-entry.ts

@@ -0,0 +1,66 @@
+// node gloss → base embeddable entry。把 node 的 canonical+gloss 落成一筆 base entry，
+// metadata.embed=true，供 base optional embed 模組讀標 → 嵌進 Vectorize（見 arcrun/kbdb src/embed.ts）。
+// 鐵律：走 base API（API-as-Wall）、零 SQL、不綁 Vectorize（embedding 是 base 職責，graph 只落標）。
+//
+// 為何要這檔：node 打標存進 entity **record**（node-persist），但 base embed 只掃 **entries**.metadata_json
+// .$.embed===true → 標在 record、讀在 entry 對不上，語意查不到圖內容。這裡補「同一 gloss 也落成 entry」。
+//
+// 冪等（base 無 upsert entry 端點）：以 node 去重鍵派生確定性 page_name（base 文件化的 idempotency key），
+// 先 listEntries({entry_type,page_name}) 查存 → 無則 create、內容變則 patch、同則 no-op。
+// [→arcrun] 若 base 日後補「POST /entries upsert（page_name 為鍵）」，這裡可收斂成單一呼叫、免 list-then-write。
+
+import type { KbdbClient } from '../lib/kbdb-client';
+
+// base embed 對「內容語意」無知，只認通用 embed 旗標；entry_type 供向量 metadata 過濾/辨識這批是圖節點 gloss。
+export const NODE_GLOSS_ENTRY_TYPE = 'graph_node_gloss';
+
+export type GlossEntryInput = {
+  canonical: string;
+  node_id?: string;
+  gloss?: string;
+  source?: string; // 沿用 node 的 ingest 來源（envelope source.uri）；存量回填未知則留空
+};
+
+export type GlossEntryOutcome = 'created' | 'updated' | 'unchanged' | 'skipped';
+
+/** node 去重鍵（同 persistNodes：id 優先、無則 canonical）→ 確定性 idempotency key。 */
+function glossKey(canonical: string, node_id?: string): string {
+  return `gloss:${(node_id || canonical).toLowerCase().trim()}`;
+}
+
+/**
+ * 把一個 node 的 gloss 落成 embeddable base entry（冪等）。
+ * - 空 gloss（或空 canonical）→ 跳過：base 對空 content 本就跳過 embed，且裸名的語意召回價值低、
+ *   keyword 搜尋已覆蓋 → 不造無意義 entry（契約允許「空 gloss 可跳過」）。
+ * - content = `canonical：gloss`（名+描述一起 embed，利於語意召回）。
+ * - metadata_json.embed=true（base 讀此旗標）、source、node_id、canonical（回連原 node）。
+ */
+export async function upsertGlossEntry(
+  client: KbdbClient,
+  node: GlossEntryInput,
+  owner_id?: string,
+): Promise<GlossEntryOutcome> {
+  const canonical = (node.canonical || '').trim();
+  const gloss = (node.gloss || '').trim();
+  if (!canonical || !gloss) return 'skipped';
+
+  const page_name = glossKey(canonical, node.node_id);
+  const content = `${canonical}：${gloss}`;
+  const metadata_json = JSON.stringify({
+    embed: true,
+    source: node.source || '',
+    node_id: node.node_id || '',
+    canonical,
+  });
+
+  // 確定性 key 去重：同一 node 重複 ingest 不造重複 entry。
+  const existing = await client.listEntries({ entry_type: NODE_GLOSS_ENTRY_TYPE, page_name, owner_id });
+  if (existing.length > 0) {
+    const e = existing[0];
+    if (e.content === content) return 'unchanged'; // 同內容 → no-op
+    await client.updateEntry(e.id, { content, metadata_json }); // gloss 變 → 更新（base PATCH 觸發重嵌）
+    return 'updated';
+  }
+  await client.createEntry({ content, entry_type: NODE_GLOSS_ENTRY_TYPE, owner_id, page_name, metadata_json });
+  return 'created';
+}

src/actions/node-persist.ts

@@ -4,6 +4,7 @@
 
 import type { KbdbClient } from '../lib/kbdb-client';
 import { TPL_ENTITY, ensurePluginTemplates } from '../lib/templates';
+import { upsertGlossEntry } from './gloss-entry';
 
 export type IngestNode = {
   name: string;
@@ -23,6 +24,7 @@ export async function persistNodes(
   client: KbdbClient,
   nodes: IngestNode[],
   owner_id?: string,
+  source?: string,  // envelope source.uri，帶進 gloss entry 的 metadata.source（供 base backfill 依 source 過濾）
 ): Promise<void> {
   if (!nodes || nodes.length === 0) return;
   await ensurePluginTemplates(client);
@@ -46,5 +48,12 @@ export async function persistNodes(
       },
       owner_id,
     );
+
+    // 另落一筆 embeddable base entry（metadata.embed=true）——record 的 gloss 標 base embed 讀不到，
+    // 必須也落成 entry base embed 模組才掃得到（打標≠讀標的修補）。只在要 embed（embed !== false）時落；
+    // 空 gloss 由 upsertGlossEntry 自行跳過。冪等：同 node 重複 ingest 不造重複 entry。
+    if (n.embed !== false) {
+      await upsertGlossEntry(client, { canonical: n.name, node_id: n.id, gloss: n.gloss, source }, owner_id);
+    }
   }
 }

src/actions/triplet-ingest.ts

@@ -84,7 +84,8 @@ export async function ingestEnvelope(
 
   // 1b) 落地 node 層打標（embed / gloss / aliases），供 base embed 模組讀標執行 embedding。
   //     graph 自己不算向量（鐵律一致）。id 作去重鍵：同一卡（同 id/檔名）只存一筆 entity，不以邊數重複。
-  await persistNodes(client, env.nodes ?? [], owner_id);
+  //     並為每個 node 另落一筆 embeddable base entry（source.uri 帶進 metadata.source）。
+  await persistNodes(client, env.nodes ?? [], owner_id, env.source.uri);
 
   // 2) 後翻舊批 status=deprecated（指向本批 source_uri；append 在前 → 無空窗）。
   for (const old of priorActive) {

src/lib/kbdb-client.ts

@@ -13,6 +13,9 @@ export type BaseEntry = {
   owner_id: string | null;
   parent_id?: string | null;
   page_name?: string | null;
+  // base entries 的通用 metadata（TEXT，JSON 字串）。base embed 模組讀 metadata_json.$.embed / $.source
+  // 決定要不要嵌、嵌進哪個 source 分組（見 arcrun/kbdb src/embed.ts）。插件只落標、不算向量。
+  metadata_json?: string | null;
   created_at?: number;
   updated_at?: number;
 };
@@ -28,7 +31,10 @@ export type CreateEntryInput = {
   entry_type: string;
   owner_id?: string;
   parent_id?: string;
+  // page_name = base 文件化的 idempotency key（entry-crud.ts：exact-match lookup）。
   page_name?: string;
+  // metadata_json = base 既有欄位（JSON 字串）。標 { embed:true, source, ... } 供 base embed 模組讀標執行。
+  metadata_json?: string;
 };
 
 /** 基本盤 API client。所有方法 = 一個 HTTP 呼叫，零 SQL。 */

src/routes/entities.ts

@@ -6,6 +6,7 @@ import {
   rejectPendingAlias,
 } from '../actions/entity-pending';
 import { listTripletEntities } from '../actions/triplet-entities';
+import { backfillGlossEntries } from '../actions/backfill-gloss-entries';
 import { makeKbdbClient } from '../lib/kbdb-client';
 
 const entityRoutes = new OpenAPIHono<{ Bindings: Bindings }>();
@@ -64,4 +65,13 @@ entityRoutes.post('/pending/:id/reject', async (c) => {
   return c.json({ success: true, action: 'rejected', newEntity });
 });
 
+// POST /backfill-gloss-entries — 存量回填：對既有 entity records 補 embeddable base entry（metadata.embed=true）。
+// route 只驗參數 + 呼叫 action（樂高法：無業務邏輯）。冪等，可重複呼叫。
+entityRoutes.post('/backfill-gloss-entries', async (c) => {
+  const body = (await c.req.json().catch(() => ({}))) as { owner_id?: string };
+  const owner_id = c.req.query('owner_id') || body?.owner_id || undefined;
+  const result = await backfillGlossEntries(makeKbdbClient(c.env), owner_id);
+  return c.json({ success: true, ...result });
+});
+
 export { entityRoutes };

tests/gloss-entry.test.ts

@@ -0,0 +1,120 @@
+// node gloss → embeddable base entry：走 mock KbdbClient（API-as-Wall），零 SQL、不打網路。
+// 覆蓋：前向 persistNodes 多落 embeddable entry / embed=false 不落 / 空 gloss 不落 / 冪等不重複 /
+//       gloss 變則更新 / backfill 對既有 entity records 補 entry（含冪等、embed=false 略過）。
+import { describe, it, expect } from 'vitest';
+import { persistNodes } from '../src/actions/node-persist';
+import { backfillGlossEntries } from '../src/actions/backfill-gloss-entries';
+import { NODE_GLOSS_ENTRY_TYPE } from '../src/actions/gloss-entry';
+import { TPL_ENTITY } from '../src/lib/templates';
+import { mockClient } from './mock-client';
+
+const glossEntries = (c: ReturnType<typeof mockClient>) =>
+  c.listEntries({ entry_type: NODE_GLOSS_ENTRY_TYPE });
+
+describe('persistNodes — 前向：每個 node 另落一筆 embeddable base entry', () => {
+  it('有 gloss 的 node → 落 entry：content=名+gloss、metadata.embed=true、帶 source/node_id', async () => {
+    const c = mockClient();
+    await persistNodes(
+      c,
+      [{ name: '系統動力學', id: 'sd.md', gloss: '用因果圖表解複雜系統的方法論' }],
+      'leo21c',
+      'github:uncle6me-web/wiki@sd.md',
+    );
+
+    const entries = await glossEntries(c);
+    expect(entries.length).toBe(1);
+    const e = entries[0];
+    expect(e.content).toBe('系統動力學：用因果圖表解複雜系統的方法論');
+    expect(e.page_name).toBe('gloss:sd.md');
+    expect(e.owner_id).toBe('leo21c');
+    const meta = JSON.parse(e.metadata_json!);
+    expect(meta.embed).toBe(true);              // 關鍵：base embed 模組讀這個
+    expect(meta.source).toBe('github:uncle6me-web/wiki@sd.md');
+    expect(meta.node_id).toBe('sd.md');
+    expect(meta.canonical).toBe('系統動力學');
+
+    // entity record 仍照舊存在（兩者並存：record 給圖、entry 給 embed）。
+    const recs = await c.listRecordsByTemplate(TPL_ENTITY);
+    expect(recs.find((r) => r.values.canonical === '系統動力學')).toBeTruthy();
+  });
+
+  it('embed=false 的 node → 不落 embeddable entry', async () => {
+    const c = mockClient();
+    await persistNodes(c, [{ name: '黃仁勳', id: '黃仁勳', gloss: 'NVIDIA 創辦人', embed: false }]);
+    expect((await glossEntries(c)).length).toBe(0);
+  });
+
+  it('空 gloss 的 node → 不落 embeddable entry（不造無意義空殼）', async () => {
+    const c = mockClient();
+    await persistNodes(c, [{ name: '某卡', id: 'card.md' }]);
+    expect((await glossEntries(c)).length).toBe(0);
+  });
+
+  it('冪等：同一 node 重複 ingest → 只一筆 embeddable entry', async () => {
+    const c = mockClient();
+    const nodes = [{ name: '長壽', id: 'longevity', gloss: '活得更久本身具有價值' }];
+    await persistNodes(c, nodes, 'leo21c', 'u1');
+    await persistNodes(c, nodes, 'leo21c', 'u1'); // 再送一次
+    expect((await glossEntries(c)).length).toBe(1);
+  });
+
+  it('gloss 變更 → 更新既有 entry 內容（仍只一筆）', async () => {
+    const c = mockClient();
+    await persistNodes(c, [{ name: '長壽', id: 'longevity', gloss: '舊描述' }], 'leo21c');
+    await persistNodes(c, [{ name: '長壽', id: 'longevity', gloss: '活得更久本身具有價值' }], 'leo21c');
+    const entries = await glossEntries(c);
+    expect(entries.length).toBe(1);
+    expect(entries[0].content).toBe('長壽：活得更久本身具有價值');
+  });
+});
+
+describe('backfillGlossEntries — 存量：對既有 entity records 補 embeddable entry', () => {
+  // 直接以 entity record 造存量（模擬既有 16 筆），不經前向路徑。
+  async function seedEntity(
+    c: ReturnType<typeof mockClient>,
+    v: { canonical: string; node_id?: string; gloss?: string; embed?: string },
+  ) {
+    await c.createRecord(TPL_ENTITY, {
+      canonical: v.canonical,
+      node_id: v.node_id ?? '',
+      aliases_json: '[]',
+      entity_type: '',
+      gloss: v.gloss ?? '',
+      embed: v.embed ?? 'true',
+      owner: '',
+    });
+  }
+
+  it('有 gloss 的既有 record → 落 entry；embed=false / 空 gloss → 略過', async () => {
+    const c = mockClient();
+    await seedEntity(c, { canonical: '長壽', node_id: 'longevity', gloss: '活得更久本身具有價值' });
+    await seedEntity(c, { canonical: '系統動力學', node_id: 'sd', gloss: '用因果圖表解複雜系統的方法論' });
+    await seedEntity(c, { canonical: '無標', node_id: 'x', gloss: '不該嵌', embed: 'false' });
+    await seedEntity(c, { canonical: '空描述', node_id: 'y' }); // 空 gloss
+
+    const res = await backfillGlossEntries(c);
+    expect(res.scanned).toBe(4);
+    expect(res.created).toBe(2);
+    expect(res.skipped).toBe(2); // embed=false + 空 gloss
+
+    const entries = await glossEntries(c);
+    expect(entries.length).toBe(2);
+    expect(entries.every((e) => JSON.parse(e.metadata_json!).embed === true)).toBe(true);
+    expect(entries.map((e) => e.content).sort()).toEqual(
+      ['系統動力學：用因果圖表解複雜系統的方法論', '長壽：活得更久本身具有價值'].sort(),
+    );
+  });
+
+  it('冪等：連跑兩次 backfill → 不造重複（第二次全 unchanged）', async () => {
+    const c = mockClient();
+    await seedEntity(c, { canonical: '長壽', node_id: 'longevity', gloss: '活得更久本身具有價值' });
+
+    const first = await backfillGlossEntries(c);
+    expect(first.created).toBe(1);
+
+    const second = await backfillGlossEntries(c);
+    expect(second.created).toBe(0);
+    expect(second.unchanged).toBe(1);
+    expect((await glossEntries(c)).length).toBe(1);
+  });
+});

tests/mock-client.ts

@@ -16,7 +16,16 @@ export class MockKbdbClient {
 
   async createEntry(input: any): Promise<BaseEntry> {
     const id = this.id('entry');
-    const entry: BaseEntry = { id, content: input.content ?? null, entry_type: input.entry_type, owner_id: input.owner_id ?? null };
+    // 對齊 base entry-crud：保留 page_name（idempotency key）、metadata_json（embed 打標）、parent_id。
+    const entry: BaseEntry = {
+      id,
+      content: input.content ?? null,
+      entry_type: input.entry_type,
+      owner_id: input.owner_id ?? null,
+      parent_id: input.parent_id ?? null,
+      page_name: input.page_name ?? null,
+      metadata_json: input.metadata_json ?? null,
+    };
     this.entries.set(id, entry);
     return entry;
   }
@@ -26,8 +35,13 @@ export class MockKbdbClient {
   }
 
   async listEntries(filters: any = {}): Promise<BaseEntry[]> {
+    // 對齊 base entry-crud listEntries 的 exact-match filters（含 page_name idempotency key、parent_id）。
     return [...this.entries.values()].filter(
-      (e) => (!filters.entry_type || e.entry_type === filters.entry_type) && (!filters.owner_id || e.owner_id === filters.owner_id),
+      (e) =>
+        (!filters.entry_type || e.entry_type === filters.entry_type) &&
+        (!filters.owner_id || e.owner_id === filters.owner_id) &&
+        (!filters.parent_id || e.parent_id === filters.parent_id) &&
+        (!filters.page_name || e.page_name === filters.page_name),
     );
   }